MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187145	ATA	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187145	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187145	A	6	6	609	614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187145	A	7	7	623	629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187145	AAT	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187145	GGTA	2	8	710	717	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187145	TA	4	8	805	812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187145	TAAT	2	8	869	876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187145	TA	3	6	978	983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187145	TTA	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187145	ATA	2	6	1011	1016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187145	A	6	6	1016	1021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187145	CCT	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NT_187145	AT	3	6	1626	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187145	TAT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187145	CAT	2	6	1647	1652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187145	AAT	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187145	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187145	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187145	TTAAA	2	10	1732	1741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187145	TTTAA	2	10	1764	1773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187145	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187145	TAT	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187145	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187145	AGT	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187145	ATTT	2	8	1954	1961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187145	TAG	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187145	ATGT	2	8	1995	2002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187145	TGCTT	2	10	2006	2015	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NT_187145	ATA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187145	TA	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187145	TA	3	6	2038	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187145	TTA	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187145	ATT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187145	TAAT	2	8	2112	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187145	GTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187145	TAT	2	6	2163	2168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187145	T	6	6	2215	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187145	ATT	2	6	2227	2232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187145	TA	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187145	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187145	ATT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187145	T	7	7	2289	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187145	T	8	8	2300	2307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187145	ATGT	2	8	2341	2348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187145	TAA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187145	ATA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187145	TA	4	8	3005	3012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187145	ATT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187145	GTAA	2	8	3052	3059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187145	AATA	2	8	3076	3083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187145	ATT	2	6	3118	3123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187145	CTTTA	2	10	3140	3149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NT_187145	AGATTA	2	12	3168	3179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187145	T	6	6	3182	3187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187145	AAT	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187145	ATTT	2	8	3268	3275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187145	TAAAT	2	10	3284	3293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187145	TA	3	6	3296	3301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187145	ATT	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187145	AAT	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187145	AGG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187145	AAG	2	6	4305	4310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187145	CT	3	6	4328	4333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187145	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187145	T	6	6	4387	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187145	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187145	TAA	2	6	4472	4477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187145	AATA	2	8	4494	4501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.